平成２６年１２月３１日までは「特定疾患治療研究事業」、平成２７年１月１日以降は「難病の患者に対する医療等に関する法律」施行に伴い、新たな医療費助成制度が開始され、特定医療費（指定難病）の支給を行っております。
スモン及び、プリオン病（ヒト由来乾燥硬膜移植によるクロイツフェルト・ヤコブ病に限る）のみ、平成２７年以降も引き続き特定疾患治療研究事業で医療費助成を行います。
認定されると、一定の自己負担額のもとに医療費の公費負担が行われます。
自己負担上限額は、同一医療保険に加入している世帯全員分の市・府民税課税額で決定されます。
申請には、申請書、診断書等の書類が必要となります。対象疾患、申請方法、 必要書類等の詳細は京都府及び京都市の担当課及び、各区支所の保健福祉センター障害保健福祉課（京北地域にお住いの方は、京北出張所保健福祉第二担当）にお問い合わせください。 また、申請の詳細は関連ホームページにも掲載しております。
※関連ホームページ参照（難病の医療費助成について）
＜お問い合わせ先＞
京都府健康対策課
電話０７５‐４１４‐４７２５（特定疾患治療研究事業に関すること）
京都市障害保健福祉推進室（特定医療費認定事務センター）
電話０７５‐７４８‐１２００（特定医療費に関すること）
【各区・支所保健福祉センター健康福祉部障害保健福祉課】
※関連ホームページ参照